tala fou

I le sefulu tausaga ua tuanaʻi, ua faʻaaogaina tele tekinolosi faʻasologa o kene i suʻesuʻega o le kanesa ma faʻataʻitaʻiga falemaʻi, ua avea ma meafaigaluega taua e faʻaalia ai uiga mole o le kanesa. O le alualu i luma i suʻesuʻega mole mole ma togafitiga faʻatatau ua unaʻia ai le atinaʻeina o manatu faʻapitoa mo togafitiga ma aumaia suiga tetele i le vaega atoa o suʻesuʻega ma togafitiga. E mafai ona fa'aoga su'esu'ega fa'atupu kenera e lapata'ia ai le lamatiaga o le kanesa, ta'ita'ia fa'ai'uga togafitiga ma iloilo fa'ama'i, ma ose meafaigaluega taua e fa'aleleia ai taunu'uga o le falema'i. O iinei, matou te aoteleina ai tala lata mai na lomia i le CA Cancer J Clin, JCO, Ann Oncol ma isi api talaaga e toe iloilo ai le faʻaogaina o suʻega faʻavae i suʻesuʻega ma togafitiga o le kanesa.

Suiga somatic ma suiga ole germline. I le tulaga lautele, o le kanesa e mafua mai i suiga o le DNA e mafai ona tuufaasolo mai matua (germline mutations) pe maua i le matua (somatic mutations). Ole suiga ole laina ole germ e iai mai lava ile fanau mai, ma e masani ona feaveai e le mutator le suiga i le DNA o sela uma i totonu o le tino ma e mafai ona tuufaasolo atu i fanau. O suiga o le somatic e maua e tagata ta'ito'atasi i sela e le o ta'aloga ma e masani lava e le tu'uina atu i fanau. Ole germline ma somatic mutations e mafai ona fa'aumatia le gaioiga masani o sela ma ta'ita'ia ai suiga leaga o sela. Somatic mutations o se faʻataʻitaʻiga autu o le maʻi ma o le biomarker sili ona vavalo i le oncology; ae ui i lea, e tusa ma le 10 i le 20 pasene o tagata mama'i tuma e tauaveina suiga o germline e matua faateleina ai le lamatiaga o le kanesa, ma o nisi o nei suiga e togafitia foi.
Suiga aveta'avale ma suiga o le pasese. E le o suiga uma o DNA e a'afia ai le gaioiga o le sela; i luga o le averesi, e manaʻomia le lima i le sefulu genomic mea tutupu, ua taʻua o "driver mutations," e faʻaosoina cell degeneration masani. Ole suiga ole aveta'avale e masani ona tupu ile kenera e feso'ota'i vavalalata ma gaioiga o le ola sela, e pei o kenera e a'afia i le fa'atonutonuina o le tuputupu a'e o le sela, toe fa'aleleia o le DNA, fa'atonutonuina o le ta'amilosaga o le sela ma isi fa'agasologa o le olaga, ma e iai le avanoa e fa'aaogaina e fai ma taula'iga togafitiga. Ae ui i lea, o le aofaʻi o suiga i soʻo se kanesa e fai si tele, e amata mai i nai afe i nisi o kanesa o le susu i le sili atu i le 100,000 i nisi o kanesa e matua fesuisuiai colorectal ma endometrial. O le tele o suiga e leai pe fa'atapula'aina le taua o le ola, e tusa lava pe tupu le suiga i le coding region, o ia fa'alavelave fa'aletonu e ta'ua o "mutation pasese". Afai e va'aia e se kenera ese'ese i se ituaiga tumo lona tali atu po'o le tete'e atu i togafitiga, o le fesuiaiga e manatu ile falema'i.
Oncogenes ma genes suppressor tumo. O kenera e masani ona suia i le kanesa e mafai ona vaevaeina i ni vaega se lua, oncogenes ma genes suppressor genes. I totonu o sela masani, o le polotini e faʻapipiʻiina e oncogenes e tele lava ina taʻalo le sao o le faʻalauteleina o le cell ma faʻalavelaveina le apoptosis cell, ae o le porotini faʻapipiʻiina e genes oncosuppressor e masani lava ona nafa ma le faʻatonutonuina le lelei o le vaevaega o sela e faʻamautu ai le gaioiga masani. I le faʻagasologa o suiga leaga, genomic mutation e taʻitaʻia ai le faʻaleleia o le gaioiga o le oncogene ma le faʻaitiitia poʻo le leiloa o le gaioiga o le oncosuppressor gene.
Laititi fesuiaiga ma fesuiaiga faʻavae. O ituaiga autu ia e lua o suiga i le genome. O nai suiga laiti e suia ai le DNA e ala i le suia, tapeina, poʻo le faʻaopoopoina o se numera itiiti o faʻavae, e aofia ai le faʻaofiina o le faavae, tapeina, faʻapipiʻiina, amata le leiloa o le codon, taofi le suiga o le codon, ma isi. O nei suiga e mafai ona mafua ai le faʻaitiitia poʻo le faʻaleleia o le gaioiga o porotini. E le gata i suiga i le tulaga o kenera ta'itasi, o saini genomic ose vaega fo'i o lipoti fa'asologa o falema'i. Genomic saini e mafai ona vaʻaia o ni mamanu lavelave o suiga laiti ma / poʻo faʻavae, e aofia ai le uta mutation mutation (TMB), microsatellite le mautu (MSI), ma faʻaletonu toe tuʻufaʻatasia.

Clonal mutation ma subclonal mutation. O suiga o Clonal o lo'o i ai i sela tumo uma, o lo'o iai ile su'esu'ega, ma tumau pea pe a mae'a togafitiga. O le mea lea, o suiga o le clonal e mafai ona fa'aaogaina e fai ma fa'amoemoega fa'ama'i tumo. Subclonal mutations o lo'o i ai i na'o se vaega o sela o le kanesa ma e mafai ona iloa i le amataga o su'esu'ega, ae mou atu i le toe tupu mulimuli ane pe fa'aalia pe a uma togafitiga. Ole heterogeneity ole kanesa e faasino ile iai ole tele o suiga ole subclonal ile kanesa e tasi. Ae maise lava, o le tele o suiga ogaoga a le aveta'avale i ituaiga uma o le kanesa masani o suiga fa'ato'aga ma tumau mautu i le alualu i luma o le kanesa. Tete'e, lea e masani ona fa'atalanoaina e subclones, atonu e le mafai ona iloa ile taimi ole su'esu'ega ae fa'aalia pe a toe fo'i pe a uma togafitiga.

Ole auala masani ole FISH poo le cell karyotype e fa'aoga e iloa ai suiga ile tulaga ole chromosomal. E mafai ona fa'aogaina le FISH e su'esu'e ai fa'atupu fusuaga, soloia, ma fa'ateleina, ma ua ta'ua o le "tulaga auro" mo le su'eina o ia ituaiga suiga, e maualuga le sa'o ma le ma'ale'ale ae fa'atapula'aina le gaosiga. I nisi o ma'i ma'i hematologic, aemaise le lukimia mata'utia, o lo'o fa'aogaina pea le karyotyping e ta'ita'ia ai su'esu'ega ma fa'amasani, ae o lenei metotia o lo'o faasolosolo malie ona suia i su'esu'ega mole mole e pei ole FISH, WGS, ma le NGS.
Suiga i kenera ta'itasi e mafai ona iloa e le PCR, PCR taimi moni ma PCR pa'u numera. O nei metotia e maualuga le maaleale, e sili ona talafeagai mo le suʻesuʻeina ma le mataʻituina o manuʻa laiti o totoe, ma e mafai ona maua iʻuga i se taimi puupuu, o le faʻaletonu o le faʻatapulaʻaina o le vaʻaia (e masani lava ona iloa suiga i se tasi poʻo ni nai genes), ma le mafai ona faʻataʻitaʻiina le tele o suʻega e faʻatapulaʻaina.
Immunohistochemistry (IHC) o se mea e mataʻituina ai le polotini e masani ona faʻaaogaina e iloa ai le faʻaalia o biomarkers e pei ole ERBB2 (HER2) ma estrogen receptors. E mafai fo'i ona fa'aoga le IHC e su'esu'e ai polotini fa'aliliu fa'apitoa (e pei o le BRAF V600E) ma fusuaga fa'apitoa (e pei o fusuaga ALK). O le lelei o le IHC e mafai ona faigofie ona tuʻufaʻatasia i le faʻasologa masani o suʻesuʻega o mea, ina ia mafai ona tuʻufaʻatasia ma isi suʻega. E le gata i lea, e mafai e le IHC ona tuʻuina atu faʻamatalaga e uiga i le faʻaogaina o le protein subcellular localization. O mea le lelei o le faʻatapulaʻaina o le scalability ma le maualuga o manaʻoga faʻalapotopotoga.
Fa'asologa o augatupulaga lona lua (NGS) O lo'o fa'aogaina e le NGS auala fa'asolosolo fa'atutusa maualuga e iloa ai suiga i le DNA ma/po'o le RNA. O lenei metotia e mafai ona faʻaogaina e faʻasologa uma ai le genome atoa (WGS) ma le kenera itulagi e fiafia i ai. O le WGS o loʻo tuʻuina atu faʻamatalaga sili ona atoatoa genomic mutation, ae o loʻo i ai le tele o faʻalavelave i lona faʻaogaina o le falemaʻi, e aofia ai le manaʻomia mo faʻataʻitaʻiga fou o le tumo (WGS e leʻo talafeagai mo le suʻeina o faʻataʻitaʻiga formalin-immobilized) ma le tau maualuga.
O le fa'asologa o le NGS e aofia ai le fa'asologa atoa o le fa'asologa ma le fa'asologa o kenera. O nei suʻega e faʻatamaoaigaina ai itulagi e fiafia i ai e ala i suʻesuʻega DNA poʻo le PCR faʻalauteleina, ma faʻatapulaʻaina ai le aofaʻi o le faʻasologa e manaʻomia (o le exome atoa e maua ai le 1 i le 2 pasene o le genome, ma e oʻo lava i paneli tetele e aofia ai le 500 genes e naʻo le 0.1 pasene o le genome). E ui o le fa'asologa atoa o le exon e lelei le fa'atinoina i totonu o pepa fa'apipi'i formalin, e tumau pea lona tau. O tu'ufa'atasiga tu'ufa'atasiga e fai si taugofie ma mafai ai ona fetu'una'i i le filifilia o kenera e su'eina. E le gata i lea, o le faʻasalalauina o le DNA saoloto (cfDNA) o loʻo faʻaalia e avea o se filifiliga fou mo suʻesuʻega genomic o tagata mamaʻi kanesa, e taʻua o vai biopsies. O sela o le kanesa ma sela masani e mafai ona faamatuu atu le DNA i totonu o le toto, ma o le DNA e faamaligiina mai sela o le kanesa e taʻua o le DNA tumo taamilo (ctDNA), lea e mafai ona suʻesuʻeina e iloa ai suiga e ono tutupu i sela tuma.
Ole filifiliga ole su'ega e fa'alagolago ile fa'afitauli fa'apitoa ole falema'i e tatau ona fo'ia. Ole tele ole biomarkers e feso'ota'i ma togafitiga fa'amaonia e mafai ona iloa ile FISH, IHC, ma le PCR. O nei metotia e talafeagai mo le suʻesuʻeina o vaega laiti o biomarkers, ae latou te le faʻaleleia le lelei o le suʻesuʻeina ma le faʻateleina o le gaosiga, ma afai e tele naua biomarkers e iloa, atonu e le lava le tino mo le suʻeina. I nisi o kanesa fa'apitoa, e pei o le kanesa o le mama, lea e faigata ai ona maua ni fa'ata'ita'iga o mea'ai ma e tele biomarkers e su'e ai, o le fa'aaogaina o le NGS o se filifiliga sili atu. I le faaiuga, o le filifiliga o le suʻega e faʻalagolago i le numera o biomarkers e suʻeina mo maʻi taʻitasi ma le numera o tagata gasegase e suʻeina mo le biomarker. I nisi tulaga, o le faʻaaogaina o le IHC / FISH e lava, aemaise lava pe a faʻamaonia le faʻamoemoe, e pei o le suʻesuʻeina o le estrogen receptors, progesterone receptors, ma le ERBB2 i gasegase o le susu. Afai e manaʻomia le suʻesuʻeina atili o suiga o genomic ma le suʻesuʻeina o faʻamoemoega faʻapitoa, ole NGS e sili atu ona faʻatulagaina ma taugofie. E le gata i lea, e mafai ona iloiloina le NGS i mataupu e le mautonu pe le mautonu taunuuga o le IHC/FISH.

O ta'iala 'ese'ese e tu'uina mai ai ta'iala po'o fea tagata gasegase e tatau ona agava'a mo su'ega fa'a-genes. I le 2020, na tuʻuina atu ai e le ESMO Precision Medicine Working Group le suʻega NGS muamua mo tagata mamaʻi e maua i le kanesa maualuga, fautuaina le suʻega NGS masani mo le kanesa o le mama mama, prostate cancer, colorectal cancer, bile duct cancer, ma ovarian cancer tumor samples, ma i le 2024, ESMO faʻafouina i luga o lenei faʻavae o le kanesa o le susu, fautuaina le kanesa o le susu. E pei ole gastrointestinal stromal tuma, sarcomas, thyroid kanesa ma kanesa e le iloa le amataga.
I le 2022, o le ASCO's Clinical Opinion on somatic genome testing i tagata mamaʻi e maua i le metastatic poʻo le kanesa maualuga o loʻo taʻua ai afai e faʻamaonia se togafitiga e fesoʻotaʻi ma biomarker i tagata mamaʻi e maua i le metastatic poʻo le maualuga o le toto totoa, e fautuaina le suʻega faʻapitoa mo nei gasegase. Mo se faʻataʻitaʻiga, e tatau ona faia suʻega genomic i tagata mamaʻi e maua i le metastatic melanoma e suʻe ai suiga o le BRAF V600E, ona o le RAF ma MEK inhibitors ua faʻamaonia mo lenei faʻamatalaga. E le gata i lea, e tatau foi ona faia su'esu'ega o kenera pe a iai se fa'ailoga manino o le tete'e mo le vaila'au e tu'uina atu i le tagata ma'i. Egfrmab, mo se faʻataʻitaʻiga, e le aoga ile KRAS mutant colorectal cancer. Pe a iloiloina le talafeagai o se tagata maʻi mo le faʻasologa o kenera, e tatau ona tuʻufaʻatasia le tulaga o le tino o le maʻi, faʻalavelave faʻafuaseʻi, ma le tulaga o le tumo, aua o le faasologa o laasaga e manaʻomia mo le faʻasologa o le genome, e aofia ai le faʻatagaina o le maʻi, suʻesuʻega suʻesuʻe, ma le auʻiliʻiliga o taunuuga faʻasologa, e manaʻomia ai le tagata maʻi ia lava le malosi faaletino ma le faʻamoemoe o le olaga.
I le faaopoopo atu i suiga o le somatic, o nisi o kanesa e tatau foi ona tofotofoina mo genes germline. O su'ega mo suiga ole laina siama e ono a'afia ai filifiliga mo togafitiga mo kanesa e pei ole BRCA1 ma BRCA2 suiga ile susu, ovarian, prostate, ma kanesa pancreatic. Ole suiga ole Germline e ono iai fo'i ni a'afiaga mo le su'esu'eina ma le puipuiga ole kanesa ile lumana'i ile gasegase. O ma'i e ono talafeagai mo su'ega mo suiga ole germline e mana'omia ona fa'amalieina ni tulaga fa'apitoa, e a'afia ai mea e pei o tala'aga o aiga o le kanesa, tausaga ile su'esu'ega, ma le ituaiga o kanesa. Ae ui i lea, o le tele o gasegase (e oo atu i le 50%) o loʻo tauaveina suiga faʻamaʻi i le laina siama e le ausia tuʻutuʻuga masani mo suʻega mo suiga o laina siama e faʻavae i talaʻaga o aiga. O le mea lea, ina ia faʻateleina le faʻamaoniaina o tagata e feaveaʻi suiga, ua fautuaina e le National Comprehensive Cancer Network (NCCN) le suʻesuʻeina o tagata uma poʻo le tele o tagata mamaʻi e maua i le susu, ovarian, endometrial, pancreatic, colorectal, poʻo le kanesa prostate e suʻesuʻe mo suiga o laina siama.
E tusa ai ma le taimi o suʻega kenera, ona o le tele o suiga faʻapitoa i le avetaʻavale o loʻo faʻapipiʻiina ma e mautu i le gasologa o le kanesa, e talafeagai le faia o suʻega faʻapitoa i tagata mamaʻi i le taimi o suʻesuʻega o le kanesa maualuga. Mo su'esu'ega fa'atupu fa'asolosolo, ae maise lava pe a mae'a togafitiga fa'atatau mole, e sili atu ona lelei le su'ega o le ctDNA nai lo le DNA tumo, ona o le DNA o le toto e mafai ona iai le DNA mai manu'a uma o le tumo, lea e sili atu ona maua ai fa'amatalaga e uiga i tumo heterogeneity.
Su'esu'ega o le ctDNA pe a mae'a togafitiga e ono mafai ona va'ai le tali o le tumo i togafitiga ma fa'ailoa le alualu i luma o fa'ama'i nai lo metotia fa'ata masani. Ae ui i lea, o faʻamaumauga mo le faʻaogaina o nei faʻamatalaga e taʻitaʻia ai filifiliga togafitiga e leʻi faʻamautuina, ma e le fautuaina le ctDNA suʻesuʻega seʻi vagana i suʻesuʻega faʻapitoa. E mafai fo'i ona fa'aoga le ctDNA e su'esu'e ai manu'a laiti o totoe pe a mae'a le taotoga tumo fa'ama'i. O le su'ega ctDNA pe a uma le taotoga o se va'aiga malosi o le alualu i luma o fa'ama'i ma e mafai ona fesoasoani e fuafua pe o le a manuia se tagata ma'i mai le chemotherapy adjuvant, ae e le fautuaina lava le fa'aogaina o le ctDNA i fafo atu o su'esu'ega fa'afoma'i e ta'ita'ia ai fa'ai'uga o le chemotherapy adjuvant.

Fa'asologa o Fa'amatalaga O le laasaga muamua i le fa'asologa o le genome o le fa'aputuina lea o le DNA mai fa'ata'ita'iga o tagata ma'i, saunia faletusi, ma fa'atupuina fa'amaumauga fa'asologa mata'utia. O fa'amatalaga mata'utia e mana'omia ai le fa'agaoioiga atili, e aofia ai le fa'amamaina o fa'amaumauga maualalo, fa'atusatusaina ma le genome fa'asinomaga, fa'ailoaina o ituaiga suiga eseese e ala i su'esu'ega eseese algorithms, fuafua le a'afiaga o nei suiga i le fa'aliliuga porotini, ma le fa'amamaina o suiga ole laina germ.
O fa'amatalaga o kenera aveta'avale ua mamanuina e iloa ai suiga o le aveta'avale ma le pasese. O suiga ole aveta'avale e o'o atu ai i le leiloa po'o le fa'aleleia atili o le gaioiga o le tumo suppressor gene. O nai suiga laiti e o'o atu ai i le le toe fa'aaogaina o kenera suppressor tumo e aofia ai suiga le aoga, suiga fa'avaa, ma suiga autu o le sapalai o nofoaga, fa'apea fo'i ma le fa'aitiitia o le tapeina o le codon, taofi le tapeina o le codon, ma le tele o suiga ole intron insertion/deletion. E le gata i lea, o suiga o le misi ma nai suiga laiti fa'aofi/tapē'esea e mafai fo'i ona i'u ai i le leiloa o le gaioiina o le tumo suppressor gene pe a a'afia ai vaega taua. O suiga fa'avae e mafua ai le leiloa o le gaioiga o le tumo suppressor gene e aofia ai se vaega po'o le atoa o le tapeina o kene ma isi genomic fesuiaiga e o'o atu ai i le fa'aleagaina o le fa'avaa o le faitau tusi. O nai suiga laiti e o'o atu ai i le fa'aleleia atili o galuega o le oncogenes e aofia ai suiga o le misi ma fa'aofi i totonu/tapē'ese i nisi taimi e fa'atatau i vaega taua o le porotini. I ni tulaga e seasea tupu, o le fa'aputuina o polotini po'o le fa'aogaina o suiga i nofoaga e mafai ona o'o atu ai i le fa'agaoioia o oncogenes. O suiga fa'avae e o'o atu ai i le fa'agaioiina o le oncogene e aofia ai le fa'afefiloi o ga'o, tape'esega, ma le toe fa'aluaina o kene.
O le fa'amatalaga fa'aa'ima'i ole suiga ole genomic e su'esu'eina ai le taua ole fa'amanino ole suiga ua fa'ailoaina, e pei o lo latou aoga fa'ama'i, fa'ata'ita'i, po'o se togafiti. E tele faiga fa'ailoga e fa'atatau i fa'amaoniga e mafai ona fa'aoga e ta'ita'ia ai le fa'auigaina o le fa'aliliuga o le genomic.
O le Memorial Sloan-Kettering Cancer Center's Precision Medicine Oncology Database (OncoKB) o lo'o fa'avasegaina fa'asologa o kenera i ni vaega se fa e fa'atatau i lo latou tau fa'atatau mo le fa'aaogaina o fualaau fa'asaina: Laasaga 1/2, fa'amaonia e le FDA, po'o fa'amanino fa'asoifua maloloina e vavalo le tali atu o se fa'ailoga fa'apitoa i se vaila'au fa'amaonia; Laasaga 3, FDA-faʻamaonia pe le faʻatagaina biomarkers e vavalo tali i tala fou faʻatatau i vailaʻau na faʻaalia le folafolaga i faʻataʻitaʻiga faʻataʻitaʻi, ma le Laasaga 4, biomarkers e le faʻatagaina e le FDA e vaʻai ai le tali atu i vailaʻau faʻapitoa e faʻaalia ai faʻamaoniga faʻamaonia i suʻesuʻega falemaʻi. O se vaega lona lima e fesoʻotaʻi ma le teteʻeina o togafitiga na faʻaopoopoina.
O le American Society for Molecular Pathology (AMP)/American Society of Clinical Oncology (ASCO)/College of American Pathologists (CAP) taʻiala mo le faʻamatalaina o le somatic variation vaevae somatic fesuiaiga i ni vaega se fa: Vasega I, faʻatasi ai ma le malosi faʻapitoa faʻapitoa; Vasega II, fa'atasi ai ma le taua o le falema'i; Vasega III, e le iloa le taua o le falema'i; Vasega IV, e le o iloa e taua tele. Na'o le vasega I ma le II eseese e taua mo filifiliga togafitiga.
O le ESMO's Molecular Target Clinical Operability Scale (ESCAT) o lo'o fa'avasegaina fa'asologa o kenera i la'asaga e ono: Laasaga I, sini e talafeagai mo le fa'aoga masani; O le Vaega II, o se faʻamoemoe o loʻo suʻesuʻeina pea, e ono faʻaaogaina e suʻesuʻe ai le faitau aofaʻi o tagata mamaʻi e mafai ona manuia mai le vailaʻau faʻatatau, ae manaʻomia nisi faʻamatalaga e lagolago ai. Vasega III, fa'asologa o kenera ua fa'aalia ai le aoga ile falema'i i isi ituaiga o kanesa; Vasega IV, na'o fa'asologa o kenera fa'atatau e lagolagoina e fa'amaoniga fa'apitoa; I le vasega V, o loʻo i ai faʻamaoniga e lagolago ai le taua o le faʻataʻitaʻiina o le suiga, ae o le togafitiga faʻasaina e tasi e faasaga i le sini e le faʻalauteleina ai le ola, pe mafai foi ona faʻaaogaina se togafiti faʻatasi; Vasega X, leai se aoga ole falema'i.